Authors: Kemper KE, Bowman PJ, Hayes BJ, Visscher PM, Goddard ME
(Contact: k.kemper@uq.edu.au ) Affiliation: Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBioscience, Bundoora, VIC, 3083, Australia Title: A multi-trait Bayesian method for mapping QTL and genomic prediction Journal: Genetics, Selection, Evolution : GSE, 50(1): 10 (2018)
DOI :
10.1186/s12711-018-0377-y Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk fat yield
Chr.3 : Asso:165409 . Chr.9 : Asso:165412 .
QTL for Milk protein yield
Chr.3 : Asso:165410 . Chr.9 : Asso:165413 .
QTL for Milk yield
Chr.3 : Asso:165411 . Chr.9 : Asso:165414 .
QTL for Milk beta-lactoglobulin protein content
Chr.11 : Asso:165415 , Asso:165416 , Asso:165417 , Asso:165418 , Asso:165419 , Asso:165420 , Asso:165423 , Asso:165424 , Asso:165425 , Asso:165426 , Asso:165427 , Asso:165429 , Asso:165430 , Asso:165431 , Asso:165432 , Asso:165433 , Asso:165434 , Asso:165436 , Asso:165437 , Asso:165440 , Asso:165441 , Asso:165442 , Asso:165443 , Asso:165444 , Asso:165445 , Asso:165446 , Asso:165447 , Asso:165449 , Asso:165450 , Asso:165451 , Asso:165452 , Asso:165454 , Asso:165455 , Asso:165456 , Asso:165457 , Asso:165460 , Asso:165461 , Asso:165462 , Asso:165464 , Asso:165465 , Asso:165467 , Asso:165470 , Asso:165471 , Asso:165472 , Asso:165473 , Asso:165476 , Asso:165482 , Asso:165483 , Asso:165484 , Asso:165485 , Asso:165487 , Asso:165488 , Asso:165489 , Asso:165490 , Asso:165491 , Asso:165494 , Asso:165497 , Asso:165499 , Asso:165500 , Asso:165501 , Asso:165504 , Asso:165505 , Asso:165506 , Asso:165507 , Asso:165509 , Asso:165510 , Asso:165512 , Asso:165514 , Asso:165515 , Asso:165516 , Asso:165517 , Asso:165519 , Asso:165520 , Asso:165522 , Asso:165525 , Asso:165527 , Asso:165529 , Asso:165531 , Asso:165533 , Asso:165535 , Asso:165537 , Asso:165539 , Asso:165540 , Asso:165541 , Asso:165545 , Asso:165547 , Asso:165548 , Asso:165550 , Asso:165551 , Asso:165552 , Asso:165553 , Asso:165554 , Asso:165556 , Asso:165558 , Asso:165563 , Asso:165568 , Asso:165569 , Asso:165570 , Asso:165571 , Asso:165575 , Asso:165577 , Asso:165578 , Asso:165580 , Asso:165581 , Asso:165583 , Asso:165589 , Asso:165590 , Asso:165591 , Asso:165592 , Asso:165593 , Asso:165594 , Asso:165595 , Asso:165597 , Asso:165598 , Asso:165599 , Asso:165601 , Asso:165603 , Asso:165606 , Asso:165607 , Asso:165608 , Asso:165609 , Asso:165611 , Asso:165612 , Asso:165613 , Asso:165614 , Asso:165615 , Asso:165617 , Asso:165618 , Asso:165620 , Asso:165621 , Asso:165622 , Asso:165624 , Asso:165625 , Asso:165629 , Asso:165630 , Asso:165631 , Asso:165632 , Asso:165634 , Asso:165635 , Asso:165638 , Asso:165639 , Asso:165641 , Asso:165645 , Asso:165646 , Asso:165648 , Asso:165649 , Asso:165650 , Asso:165656 , Asso:165660 , Asso:165661 , Asso:165664 , Asso:165665 , Asso:165666 , Asso:165667 , Asso:165668 , Asso:165671 , Asso:165672 , Asso:165673 , Asso:165675 , Asso:165680 , Asso:165683 , Asso:165684 , Asso:165685 , Asso:165686 , Asso:165687 , Asso:165688 , Asso:165689 , Asso:165690 , Asso:165691 , Asso:165692 , Asso:165693 .
QTL for Milk kappa-casein content
Chr.6 : Asso:165421 , Asso:165435 , Asso:165469 , Asso:165508 , Asso:165523 , Asso:165524 , Asso:165555 , Asso:165574 , Asso:165604 , Asso:165637 , Asso:165662 , Asso:165676 , Asso:165706 . Chr.14 : Asso:165459 , Asso:165543 , Asso:165565 , Asso:165584 , Asso:165588 , Asso:165652 , Asso:165669 , Asso:165677 .
QTL for Milk sodium content
Chr.1 : Asso:165651 . Chr.2 : Asso:165422 , Asso:165521 , Asso:165534 , Asso:165536 , Asso:165542 , Asso:165559 .
QTL for Milk phosphorus content
Chr.1 : Asso:165428 , Asso:165466 , Asso:165475 , Asso:165480 , Asso:165493 , Asso:165496 , Asso:165498 , Asso:165502 , Asso:165513 , Asso:165518 , Asso:165530 , Asso:165546 , Asso:165561 , Asso:165567 , Asso:165572 , Asso:165576 , Asso:165582 , Asso:165586 , Asso:165602 , Asso:165605 , Asso:165616 , Asso:165619 , Asso:165623 , Asso:165626 , Asso:165640 , Asso:165642 , Asso:165643 , Asso:165655 , Asso:165657 , Asso:165659 , Asso:165674 , Asso:165702 . Chr.12 : Asso:165478 . Chr.14 : Asso:165544 , Asso:165566 , Asso:165585 , Asso:165653 , Asso:165670 , Asso:165678 .
QTL for Milk alpha-S1-casein content
Chr.19 : Asso:165438 .
QTL for Milk lactoferrin content
Chr.22 : Asso:165439 , Asso:165448 , Asso:165453 , Asso:165463 , Asso:165474 , Asso:165477 , Asso:165495 , Asso:165526 , Asso:165528 , Asso:165549 , Asso:165573 , Asso:165579 , Asso:165596 , Asso:165610 , Asso:165627 , Asso:165644 , Asso:165654 , Asso:165663 , Asso:165679 , Asso:165681 , Asso:165682 , Asso:165701 .
QTL for Milk calcium content
Chr.14 : Asso:165458 , Asso:165587 , Asso:165636 .
QTL for Milk lactose content
Chr.6 : Asso:165468 , Asso:165481 , Asso:165486 , Asso:165511 , Asso:165600 , Asso:165628 , Asso:165633 , Asso:165708 . Chr.29 : Asso:165538 , Asso:165703 .
QTL for Milk potassium content
Chr.19 : Asso:165479 , Asso:165492 , Asso:165503 , Asso:165564 , Asso:165694 , Asso:165695 , Asso:165696 , Asso:165697 , Asso:165698 , Asso:165699 , Asso:165700 .
QTL for Milk lactoperoxidase content
Chr.20 : Asso:165532 , Asso:165560 , Asso:165647 , Asso:165658 . Chr.21 : Asso:165557 .
QTL for Milk magnesium content
Chr.20 : Asso:165707 . Chr.24 : Asso:165562 .
QTL for Milk zinc content
Chr.2 : Asso:165705 . Chr.14 : Asso:165704 .
QTL for Milk immunoglobulin G content
Chr.3 : Asso:312028 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (33) ,
Chr.2 (7) ,
Chr.3 (4) ,
Chr.6 (21) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.11 (171) ,
Chr.12 (1) ,
Chr.14 (18) ,
Chr.19 (12) ,
Chr.20 (5) ,
Chr.21 (1) ,
Chr.22 (22) ,
Chr.24 (1) ,
Chr.29 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
