Authors: Lotfizadeh F, Masoudi AA, Vaez Torshizi R, Emrani H
(Contact: masoudia@modares.ac.ir ) Affiliation: Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran. Title: Genome-wide association study of copy number variations with shank traits in a F2 crossbred chicken population. Journal: Animal Genetics, 55(4):559-574 (2024)
DOI :
10.1111/age.13447 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Shank diameter
Chr.1 : Asso:297169 , Asso:297170 , Asso:297171 , Asso:297172 , Asso:297179 , Asso:297180 , Asso:297181 , Asso:297182 , Asso:297183 , Asso:297186 , Asso:297187 , Asso:297188 , Asso:297231 , Asso:297232 , Asso:297233 , Asso:297234 , Asso:297235 . Chr.2 : Asso:297189 , Asso:297191 , Asso:297194 , Asso:297195 , Asso:297196 , Asso:297197 , Asso:297199 . Chr.3 : Asso:297200 , Asso:297201 , Asso:297202 , Asso:297247 , Asso:297248 , Asso:297249 , Asso:297250 . Chr.4 : Asso:297206 , Asso:297207 , Asso:297208 , Asso:297209 , Asso:297210 , Asso:297211 , Asso:297212 , Asso:297213 , Asso:297256 . Chr.5 : Asso:297214 , Asso:297215 , Asso:297217 . Chr.9 : Asso:297219 . Chr.12 : Asso:297227 . Chr.14 : Asso:297228 . Chr.17 : Asso:297229 . Chr.21 : Asso:297260 . Chr.28 : Asso:297261 .
QTL for Shank length
Chr.1 : Asso:297173 , Asso:297174 , Asso:297175 , Asso:297176 , Asso:297177 , Asso:297178 , Asso:297184 , Asso:297185 , Asso:297236 , Asso:297237 , Asso:297238 , Asso:297239 , Asso:297240 , Asso:297241 , Asso:297242 , Asso:297243 , Asso:297244 , Asso:297245 , Asso:297246 . Chr.2 : Asso:297190 , Asso:297192 , Asso:297193 , Asso:297198 . Chr.3 : Asso:297203 , Asso:297251 , Asso:297252 , Asso:297253 , Asso:297254 , Asso:297255 . Chr.4 : Asso:297204 , Asso:297205 , Asso:297257 , Asso:297258 . Chr.5 : Asso:297216 , Asso:297259 . Chr.8 : Asso:297218 . Chr.9 : Asso:297220 , Asso:297221 , Asso:297222 , Asso:297223 , Asso:297224 , Asso:297225 . Chr.10 : Asso:297226 . Chr.17 : Asso:297230 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (36) ,
Chr.2 (11) ,
Chr.3 (13) ,
Chr.4 (13) ,
Chr.5 (5) ,
Chr.8 (1) ,
Chr.9 (7) ,
Chr.10 (1) ,
Chr.12 (1) ,
Chr.14 (1) ,
Chr.17 (2) ,
Chr.21 (1) ,
Chr.28 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Lotfizadeh F, Masoudi AA, Vaez Torshizi R, Emrani H (2024). Genome-wide association study of copy number variations with shank traits in a F2 crossbred chicken population.. Animal Genetics, 55(4):559-574;
Curated into QTLdb on 2024-06-18. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=FpXa2N9CgO
OR
Lotfizadeh F, Masoudi AA, Vaez Torshizi R, Emrani H (2024). Genome-wide association study of copy number variations with shank traits in a F2 crossbred chicken population.. Animal Genetics, 55(4):559-574; DOI: https://dx.doi.org/10.1111/age.13447
